După invazia extraterestră, Consiliul Terrei i-a învins cu succes pe Reticulani şi mai mult decât atât, le-a descoperit planul secret: să acopere Terra cu "Biomasă", o reţea de ţesut organic extraterestru care, sperau Reticulanii, va deveni conştient şi înzestrat cu puteri psihice imense. Reticulanii care au invadat Terra nu sunt cu adevărat reprezentanţii speciei lor, sunt o facţiune rebelă care au întrerupt toate căile de comunicaţii şi au ales această parte părăsită a spaţiului pentru a-şi conduce experimentele.

  Reticulanii au construit un satelit gigant (cu o rază de mai mulţi kilometri) cu un ecosistem închis şi au mutat rămăşiţele umanităţii acolo. Experimentul cu Biomasa a continuat la suprafaţă. Apoi ceva a mers foarte prost...

• Strategia globală – misiuni tactice şi joc strategic pe glob
• O urmare pentru succesul lui UFO: Aftermath
• Noi tehnologii uimitoare şi item-uri pentru dezvoltare
• Noi inamici şi aliaţi
• Source management, Base management
• Sistem SAS îmbunătăţit şi sistem RPG
• O poveste incredibilă
• ...şi multe alte caracteristici noi